علی تاجرنیا در شبکه اجتماعی ایکس نوشت: دکتر محمد رضا عارف معاون اول خاتمی معاون اول پزشکیان شد.»

همچنین عبدالله رمضان‌زاده نیز در توییتی نوشت: دکتر عارف را سالهاست که می‌شناسم. سیاستمداری واقع‌بین، تیزهوش، با افکار اصلاح طلبانه اما میانه‌رو در عمل و دارای قدرت مدیریت تعارض‌های موجود در ساختار دولت. ‌حافظه استثنایی او در یادآوری جزئیات مطروحه در مباحث و اخلاق نیک او در مدیریت تعارض‌ها در کشور مؤثر خواهد بود./انتخاب

محمدرضا عارف در دوره دوم ریاست‌جمهوری خاتمی نیز معاول اول دولت بود.

وی پس از انصراف از رقابت‌های ریاست‌جمهوری سال ۹۲ به عنوان نماینده تهران وارد دهمین دوره مجلس شورای اسلامی شد.

وزارت پست و تلگراف‌، ریاست دانشگاه تهران و ریاست سازمان مدیریت و برنامه‌ریزی از دیگر مسئولیت‌های عارف بوده است.